Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms