Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
INTS3Q68E01 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms