Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms