Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms