Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms