Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms