Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RSPH4AQ5TD94 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms