Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf220Q5T0J3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms