Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms