Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRDTQ58F21 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms