Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms