Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms