Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms