Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms