Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
QSER1Q2KHR3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
QSER1Q2KHR3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms