Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms