Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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