Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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