Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms