Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYPL1Q16563 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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