Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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