Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms