Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN9AQ15858 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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