Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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