Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD1Q149M9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
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