Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAPQ14761 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAPQ14761 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms