Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SEMA3AQ14563 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SEMA3AQ14563 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SEMA3AQ14563 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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