Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3AQ14152 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3AQ14152 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms