Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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