Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SHROOM2Q13796 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
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