Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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