Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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