Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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