Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
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