Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)19.37■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.187e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 TYW1-206ENST00000495971 1302 ntTSL 210.17□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 TYW1-202ENST00000361660 3255 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 TMEM131L-204ENST00000445960 538 ntTSL 417.67■□□□□ 0.425e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.285e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.345e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PLPPR2-203ENST00000586431 635 ntTSL 423.76■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PLPPR2-202ENST00000586380 535 ntTSL 422.93■■□□□ 1.262e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PLPPR2-207ENST00000591329 633 ntTSL 220.65■□□□□ 0.92e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 AIG1-207ENST00000470265 572 ntTSL 25.25□□□□□ -1.571e-12■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 LINC00879-201ENST00000462219 695 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 LINC00879-203ENST00000466089 631 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 523.98■■□□□ 1.437e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.177e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 313.29□□□□□ -0.287e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.327e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.367e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 312.19□□□□□ -0.467e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.487e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.657e-8■■■■□ 23.5
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TARDBPQ13148 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 510.43□□□□□ -0.747e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 210.34□□□□□ -0.757e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.767e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.777e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 59.86□□□□□ -0.837e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.847e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.397e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.487e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 55.43□□□□□ -1.547e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 28.74□□□□□ -1.013e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.63e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -23e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.023e-8■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 511.76□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.453e-7■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-7■■■■□ 23.4
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TARDBPQ13148 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 37.2□□□□□ -1.263e-7■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 55.7□□□□□ -1.53e-7■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.17□□□□□ -1.583e-7■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.628e-8■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.448e-8■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 ATF5-203ENST00000596658 722 ntTSL 217.76■□□□□ 0.438e-8■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 ATF5-204ENST00000597227 828 ntTSL 316.87■□□□□ 0.298e-8■■■■□ 23.4
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TARDBPQ13148 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.015e-13■■■■□ 23.4
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TARDBPQ13148 ZFYVE28-203ENST00000504743 576 ntTSL 413.88□□□□□ -0.195e-13■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 37.92□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 428.18■■■□□ 2.12e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 23.4
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TARDBPQ13148 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 214.02□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 313.72□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 23.4
TARDBPQ13148 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.227e-8■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.427e-8■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 515.95■□□□□ 0.142e-11■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 515.82■□□□□ 0.125e-7■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.783e-7■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 DCUN1D4-211ENST00000506673 548 ntTSL 425.18■■□□□ 1.623e-7■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 DCUN1D4-220ENST00000511675 643 ntTSL 225.18■■□□□ 1.623e-7■■■■□ 23.3
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