Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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