Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms