Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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IFT88Q13099 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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IFT88Q13099 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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IFT88Q13099 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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IFT88Q13099 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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IFT88Q13099 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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IFT88Q13099 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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IFT88Q13099 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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