Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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