Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms