Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 ALK2YBL009W 2031 nt2.46□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 ELG1YOR144C 2376 nt2.45□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 UFD4YKL010C 4452 nt2.45□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.45□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YOR015WYOR015W 360 nt2.45□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YOL098CYOL098C 3114 nt2.45□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 HSL1YKL101W 4557 nt2.45□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YFR016CYFR016C 3702 nt2.44□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 SNC1YAL030W 354 nt2.44□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YOR333CYOR333C 417 nt2.44□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YLR149CYLR149C 2193 nt2.44□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 GYP5YPL249C 2685 nt2.43□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YDR426CYDR426C 378 nt2.43□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 PFD1YJL179W 330 nt2.43□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.43□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.43□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 CDC53YDL132W 2448 nt2.43□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 KOG1YHR186C 4674 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 SCW11YGL028C 1629 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 PEX8YGR077C 1770 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 DNF1YER166W 4716 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 SSS1YDR086C 243 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 INA22YIR024C 651 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YLR255CYLR255C 354 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 VPS34YLR240W 2628 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YGR250CYGR250C 2346 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 MET18YIL128W 3099 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 GIP3YPL137C 3831 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 SEF1YBL066C 3447 nt2.42□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 SIR4YDR227W 4077 nt2.41□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 BRE1YDL074C 2103 nt2.41□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 PXA2YKL188C 2562 nt2.41□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 snR55snR55 98 nt2.41□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 GPG1YGL121C 381 nt2.41□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.41□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 VMA9YCL005W-A 222 nt2.41□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 PAU2YEL049W 363 nt2.4□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 ISD11YER048W-A 285 nt2.4□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 EMP24YGL200C 612 nt2.4□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.4□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 CYB5YNL111C 363 nt2.4□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 USO1YDL058W 5373 nt2.4□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 VPH1YOR270C 2523 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 CRM1YGR218W 3255 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YJL135WYJL135W 318 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 PCC1YKR095W-A 267 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 SAP185YJL098W 3177 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 PEP3YLR148W 2757 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 CDC27YBL084C 2277 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 IRC8YJL051W 2469 nt2.39□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 IST2YBR086C 2841 nt2.38□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.38□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YGL052WYGL052W 306 nt2.38□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 TRL1YJL087C 2484 nt2.38□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.38□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 TUS1YLR425W 3924 nt2.38□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 GRR1YJR090C 3456 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 MMS22YLR320W 4365 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 FKS1YLR342W 5631 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YJL182CYJL182C 318 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YMR321CYMR321C 318 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YBL083CYBL083C 426 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 MNE1YOR350C 1992 nt2.37□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YBR184WYBR184W 1572 nt2.36□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 RPL42BYHR141C 321 nt2.36□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YNL114CYNL114C 372 nt2.36□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 RPL42AYNL162W 321 nt2.36□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 CSE2YNR010W 450 nt2.36□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 PLC1YPL268W 2610 nt2.35□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YDR286CYDR286C 345 nt2.35□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 RIC1YLR039C 3171 nt2.35□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.35□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 MPT5YGL178W 2580 nt2.34□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 TRX1YLR043C 312 nt2.34□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 YNL028WYNL028W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
CLF1Q12309 CFT2YLR115W 2580 nt2.34□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 RTT101YJL047C 2529 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 LCD1YDR499W 2244 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 EFR3YMR212C 2349 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 Q0092Q0092 141 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YGR151CYGR151C 336 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YOL160WYOL160W 342 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 RTT107YHR154W 3213 nt2.33□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 VIK1YPL253C 1944 nt2.32□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 CDC60YPL160W 3273 nt2.32□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YJL150WYJL150W 303 nt2.31□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.31□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 RPH1YER169W 2391 nt2.31□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 SCH9YHR205W 2475 nt2.31□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 MGM1YOR211C 2646 nt2.31□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 SMY1YKL079W 1971 nt2.3□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 snR72snR72 98 nt2.3□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 PEP1YBL017C 4740 nt2.3□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 SET2YJL168C 2202 nt2.3□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 TOR2YKL203C 7425 nt2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms