Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 MCM22YJR135C 720 nt1.81□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 CYB5YNL111C 363 nt1.81□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 NAM7YMR080C 2916 nt1.81□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 NOP53YPL146C 1368 nt1.81□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 VPS15YBR097W 4365 nt1.81□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 GRR1YJR090C 3456 nt1.8□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 PET309YLR067C 2898 nt1.8□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.8□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 PAU18YLL064C 363 nt1.8□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 PAU6YNR076W 363 nt1.8□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YSY6YBR162W-A 198 nt1.8□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 ZRG8YER033C 3231 nt1.79□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.79□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 HHT1YBR010W 411 nt1.79□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 ARP7YPR034W 1434 nt1.79□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YLR419WYLR419W 4308 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 CAT8YMR280C 4302 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YDR413CYDR413C 576 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YER097WYER097W 330 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YHL037CYHL037C 402 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YIL059CYIL059C 366 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 COA6YMR244C-A 315 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YCL046WYCL046W 324 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 HSH155YMR288W 2916 nt1.78□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 SSK2YNR031C 4740 nt1.78□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 RPH1YER169W 2391 nt1.77□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 RPL35AYDL191W 363 nt1.77□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.77□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 NUT2YPR168W 474 nt1.77□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 MSH6YDR097C 3729 nt1.77□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 SAC3YDR159W 3906 nt1.77□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 HIR3YJR140C 4947 nt1.77□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 TRM3YDL112W 4311 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 CYC7YEL039C 342 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 UPS1YLR193C 528 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 snR36snR36 182 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 SWI5YDR146C 2130 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 YOR093CYOR093C 4947 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 HDA3YPR179C 1968 nt1.76□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 CCH1YGR217W 6120 nt1.75□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 HCS1YKL017C 2052 nt1.75□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 YFL032WYFL032W 321 nt1.75□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 MVP1YMR004W 1536 nt1.75□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 TUS1YLR425W 3924 nt1.74□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.74□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.74□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 YCL023CYCL023C 348 nt1.74□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 MMS22YLR320W 4365 nt1.74□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 MSC6YOR354C 2079 nt1.72□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 SPC110YDR356W 2835 nt1.72□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 EFR3YMR212C 2349 nt1.72□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 TDA9YML081W 3756 nt1.72□□□□□ -2.13
LSP1Q12230 ZRG17YNR039C 1818 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 MAM33YIL070C 801 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YOR199WYOR199W 330 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 LAA1YJL207C 6045 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 LYS14YDR034C 2373 nt1.71□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YIL102CYIL102C 306 nt1.7□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 FMP23YBR047W 528 nt1.7□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YOP1YPR028W 543 nt1.7□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 RFX1YLR176C 2436 nt1.7□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 PET127YOR017W 2403 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 POL5YEL055C 3069 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 PFD1YJL179W 330 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 TAR1YLR154W-C 375 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 HTB2YBL002W 396 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 snR51snR51 107 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 CHS1YNL192W 3396 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 DNF3YMR162C 4971 nt1.69□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YJR039WYJR039W 3366 nt1.68□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 MSH5YDL154W 2706 nt1.68□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 SRP14YDL092W 441 nt1.68□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YDR048CYDR048C 315 nt1.68□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YGR265WYGR265W 411 nt1.68□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 RPL38YLR325C 237 nt1.68□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YGR250CYGR250C 2346 nt1.67□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 STE5YDR103W 2754 nt1.67□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YEL057CYEL057C 702 nt1.67□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YFL063WYFL063W 456 nt1.67□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.67□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 SWI6YLR182W 2412 nt1.67□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 TFC8YPL007C 1767 nt1.67□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 PAU3YCR104W 375 nt1.66□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.66□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.66□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 MON2YNL297C 4911 nt1.66□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 RIM20YOR275C 1986 nt1.66□□□□□ -2.14
LSP1Q12230 SPC98YNL126W 2541 nt1.65□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 YJL135WYJL135W 318 nt1.65□□□□□ -2.15
LSP1Q12230 TRX1YLR043C 312 nt1.65□□□□□ -2.15
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