Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 TRX1YLR043C 312 nt2.63□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 RTT107YHR154W 3213 nt2.63□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 RTT101YJL047C 2529 nt2.63□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.62□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YLR255CYLR255C 354 nt2.62□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 DCP2YNL118C 2913 nt2.62□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 RAV1YJR033C 4074 nt2.62□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 NAM7YMR080C 2916 nt2.62□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.61□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 PAU18YLL064C 363 nt2.61□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 PAU6YNR076W 363 nt2.61□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 IST2YBR086C 2841 nt2.6□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 SSD1YDR293C 3753 nt2.6□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 BRP1YGL007W 378 nt2.6□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.6□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 RPB10YOR210W 213 nt2.6□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 SPF1YEL031W 3648 nt2.6□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 LYS14YDR034C 2373 nt2.6□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 SYH1YPL105C 2550 nt2.59□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 SPG3YDR504C 384 nt2.58□□□□□ -2
SSF2Q12153 TRA1YHR099W 11235 nt2.58□□□□□ -2
SSF2Q12153 MAK10YEL053C 2202 nt2.58□□□□□ -2
SSF2Q12153 MLH1YMR167W 2310 nt2.58□□□□□ -2
SSF2Q12153 RAD61YDR014W 1944 nt2.58□□□□□ -2
SSF2Q12153 MVP1YMR004W 1536 nt2.57□□□□□ -2
SSF2Q12153 ZRG17YNR039C 1818 nt2.56□□□□□ -2
SSF2Q12153 RPL37BYDR500C 267 nt2.56□□□□□ -2
SSF2Q12153 YCL046WYCL046W 324 nt2.56□□□□□ -2
SSF2Q12153 ZIP1YDR285W 2628 nt2.56□□□□□ -2
SSF2Q12153 PLC1YPL268W 2610 nt2.56□□□□□ -2
SSF2Q12153 TFC3YAL001C 3483 nt2.56□□□□□ -2
SSF2Q12153 UTP22YGR090W 3714 nt2.56□□□□□ -2
SSF2Q12153 BNR1YIL159W 4128 nt2.55□□□□□ -2
SSF2Q12153 snR60snR60 104 nt2.55□□□□□ -2
SSF2Q12153 UBP1YDL122W 2430 nt2.55□□□□□ -2
SSF2Q12153 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.55□□□□□ -2
SSF2Q12153 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.55□□□□□ -2
SSF2Q12153 SAP185YJL098W 3177 nt2.54□□□□□ -2
SSF2Q12153 PUT3YKL015W 2940 nt2.54□□□□□ -2
SSF2Q12153 ARP7YPR034W 1434 nt2.54□□□□□ -2
SSF2Q12153 LCD1YDR499W 2244 nt2.54□□□□□ -2
SSF2Q12153 SCW11YGL028C 1629 nt2.53□□□□□ -2
SSF2Q12153 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.53□□□□□ -2
SSF2Q12153 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.53□□□□□ -2
SSF2Q12153 SDH2YLL041C 801 nt2.53□□□□□ -2
SSF2Q12153 snR49snR49 165 nt2.53□□□□□ -2
SSF2Q12153 NOP14YDL148C 2433 nt2.52□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 IRA2YOL081W 9240 nt2.52□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 ATP7YKL016C 525 nt2.52□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 IRE1YHR079C 3348 nt2.52□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.51□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.51□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YLL032CYLL032C 2478 nt2.51□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 CTR9YOL145C 3234 nt2.51□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 HER1YOR227W 3741 nt2.5□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 HMI1YOL095C 2121 nt2.5□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YOL098CYOL098C 3114 nt2.5□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YJL135WYJL135W 318 nt2.5□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YNL028WYNL028W 318 nt2.5□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 UFD4YKL010C 4452 nt2.5□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 SAS3YBL052C 2496 nt2.49□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YFR016CYFR016C 3702 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 SPT21YMR179W 2277 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 RGA1YOR127W 3024 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 CAT2YML042W 2013 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 snR72snR72 98 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.48□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.47□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.47□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 YOL160WYOL160W 342 nt2.47□□□□□ -2.01
SSF2Q12153 SSS1YDR086C 243 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 JLP2YMR132C 627 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 CSE2YNR010W 450 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 MLH3YPL164C 2148 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 YBR064WYBR064W 429 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 SAC3YDR159W 3906 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 FRK1YPL141C 2598 nt2.46□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 BUD2YKL092C 3315 nt2.45□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 VIK1YPL253C 1944 nt2.45□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 BRE1YDL074C 2103 nt2.45□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 BNI1YNL271C 5862 nt2.44□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 KTI11YBL071W-A 249 nt2.44□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 CHC1YGL206C 4962 nt2.44□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 MCD1YDL003W 1701 nt2.44□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 ATG11YPR049C 3537 nt2.44□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 TOF1YNL273W 3717 nt2.44□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 MSC6YOR354C 2079 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 MDM20YOL076W 2391 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 IRC8YJL051W 2469 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 snR55snR55 98 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 SRP14YDL092W 441 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 CDC36YDL165W 576 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 ZIP2YGL249W 2115 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 BLI1YKL061W 342 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 YBL012CYBL012C 402 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 ABF2YMR072W 552 nt2.43□□□□□ -2.02
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