Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 RPL26AYLR344W 384 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-NL1Q12112 SWM2YNR004W 441 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-NL1Q12112 VPS28YPL065W 729 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-NL1Q12112 YPR142CYPR142C 564 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-NL1Q12112 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-NL1Q12112 NOP9YJL010C 2001 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-NL1Q12112 YDR114CYDR114C 303 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 CRG1YHR209W 876 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YKL115CYKL115C 393 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 PRP42YDR235W 1635 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YPR172WYPR172W 603 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 RTC6YPL183W-A 282 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YPR170CYPR170C 336 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 snR46snR46 197 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 SBH2YER019C-A 267 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 PHO80YOL001W 882 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YKL136WYKL136W 399 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YGR042WYGR042W 816 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 RPL42BYHR141C 321 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 RFA3YJL173C 369 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 CCE1YKL011C 1062 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 RPL42AYNL162W 321 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 YPL080CYPL080C 327 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-NL1Q12112 RCO1YMR075W 2055 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 UPS1YLR193C 528 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 RRT1YBL048W 312 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 GPI2YPL076W 843 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 LCD1YDR499W 2244 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 RAD34YDR314C 2079 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 GOS1YHL031C 672 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 RTR2YDR066C 591 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YLR252WYLR252W 306 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YDL068WYDL068W 330 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 SMD2YLR275W 333 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YPL225WYPL225W 441 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YEL010WYEL010W 351 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 MMS2YGL087C 414 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 GPG1YGL121C 381 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 RPS16AYMR143W 432 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YOR169CYOR169C 465 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 SPO23YBR250W 1572 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 HNT1YDL125C 477 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YJL086CYJL086C 369 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 YNL150WYNL150W 408 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 LEE1YPL054W 906 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 ATP15YPL271W 189 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 REF2YDR195W 1602 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-NL1Q12112 RPS27AYKL156W 249 nt-0.34□□□□□ -2.46
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TY1B-NL1Q12112 LSM4YER112W 564 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 YNL211CYNL211C 261 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 FYV10YIL097W 1551 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 YDL187CYDL187C 330 nt-0.36□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 INP2YMR163C 2118 nt-0.36□□□□□ -2.47
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TY1B-NL1Q12112 AI5_BETAQ0075 1065 nt-0.37□□□□□ -2.47
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TY1B-NL1Q12112 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 YDR029WYDR029W 315 nt-0.38□□□□□ -2.47
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TY1B-NL1Q12112 ARV1YLR242C 966 nt-0.4□□□□□ -2.47
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TY1B-NL1Q12112 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 CMS1YLR003C 876 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-NL1Q12112 RAD61YDR014W 1944 nt-0.41□□□□□ -2.47
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TY1B-NL1Q12112 YDR290WYDR290W 330 nt-0.42□□□□□ -2.48
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TY1B-NL1Q12112 CSM4YPL200W 471 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 YGL042CYGL042C 306 nt-0.44□□□□□ -2.48
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TY1B-NL1Q12112 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 SEC10YLR166C 2616 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 CUL3YGR003W 2235 nt-0.44□□□□□ -2.48
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