Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YOR199WYOR199W 330 nt1.59□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 BIL1YOR304C-A 231 nt1.59□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 LRE1YCL051W 1752 nt1.59□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 PAN3YKL025C 2040 nt1.59□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 CHS1YNL192W 3396 nt1.59□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 ZRG8YER033C 3231 nt1.59□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.58□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 PAC1YOR269W 1485 nt1.58□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YBP1YBR216C 2025 nt1.58□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.58□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 TIM13YGR181W 318 nt1.58□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.58□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 IRR1YIL026C 3453 nt1.58□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YFL032WYFL032W 321 nt1.57□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 PFD1YJL179W 330 nt1.57□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.57□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.57□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 DNF3YMR162C 4971 nt1.57□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 AIM9YER080W 1884 nt1.56□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 KCS1YDR017C 3153 nt1.56□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YCR043CYCR043C 384 nt1.56□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.56□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YPL229WYPL229W 621 nt1.56□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 MNL2YLR057W 2550 nt1.55□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 MYO2YOR326W 4725 nt1.55□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.55□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.55□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 snR36snR36 182 nt1.55□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 SGO1YOR073W 1773 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 RPL35AYDL191W 363 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YER181CYER181C 324 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YHL041WYHL041W 450 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 MAM33YIL070C 801 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YIL102CYIL102C 306 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YBL083CYBL083C 426 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 SAR1YPL218W 573 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 RKM1YPL208W 1752 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 SLM1YIL105C 2061 nt1.54□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YDR008CYDR008C 351 nt1.53□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 PEP3YLR148W 2757 nt1.53□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.53□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 SEF1YBL066C 3447 nt1.53□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 YLR419WYLR419W 4308 nt1.53□□□□□ -2.16
YPQ1Q12010 MDM20YOL076W 2391 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 HIR3YJR140C 4947 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 NOP53YPL146C 1368 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 PAU3YCR104W 375 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 TOF2YKR010C 2316 nt1.52□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 SKI3YPR189W 4299 nt1.51□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 FMP23YBR047W 528 nt1.51□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 MSH3YCR092C 3057 nt1.51□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YGR250CYGR250C 2346 nt1.51□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.51□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 MVP1YMR004W 1536 nt1.5□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 SMY1YKL079W 1971 nt1.5□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 TFC8YPL007C 1767 nt1.5□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 MCM22YJR135C 720 nt1.5□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 OSH6YKR003W 1347 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YCS4YLR272C 3531 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 RPL31AYDL075W 342 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YFL063WYFL063W 456 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 RPL42BYHR141C 321 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YNL114CYNL114C 372 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 RPL42AYNL162W 321 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YBR184WYBR184W 1572 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 VPS15YBR097W 4365 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 STE5YDR103W 2754 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 MSC6YOR354C 2079 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 CTR9YOL145C 3234 nt1.49□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 MEC1YBR136W 7107 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 LHS1YKL073W 2646 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 UTP21YLR409C 2820 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 TRX1YLR043C 312 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 HUG1YML058W-A 207 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 NUT2YPR168W 474 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 PXA2YKL188C 2562 nt1.48□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 snR65snR65 100 nt1.47□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 STF2YGR008C 255 nt1.47□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 PAU18YLL064C 363 nt1.47□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 TAR1YLR154W-C 375 nt1.47□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 UPS1YLR193C 528 nt1.47□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 PAU6YNR076W 363 nt1.47□□□□□ -2.17
YPQ1Q12010 YGR130CYGR130C 2451 nt1.46□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 CYC7YEL039C 342 nt1.46□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 YIL059CYIL059C 366 nt1.46□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 RPS27AYKL156W 249 nt1.46□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 YAR029WYAR029W 225 nt1.46□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 SPO24YPR036W-A 204 nt1.46□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 YCL046WYCL046W 324 nt1.46□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 HMI1YOL095C 2121 nt1.45□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 YDR048CYDR048C 315 nt1.45□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.45□□□□□ -2.18
YPQ1Q12010 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.45□□□□□ -2.18
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