Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms