Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD3Q0VAK6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms