Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms