Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms