Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms